1999年3月微軟在中國推出維納斯計劃,圖謀通過電視布局智能終端,謀求新一代產業的控制權。方興東在3月11日的《南方周末》發表《維納斯計劃福兮禍兮?》,引起廣泛熱議.之后,他和王俊秀合作,在同年5月份完成出版了《起來——挑戰微軟霸權》一書。
2002年方興東的《向微軟投降》和《微軟為什么》兩篇文章先后發表，但僅僅活了一兩個小時，就全部被替換成了微軟的廣告，這次刪稿事件令方興東十分氣憤，也成為了他創辦博客中國的誘因。
2002年8月初，“博客中國”正式成立，方興東和王俊秀發表了《中國博客宣言》文中稱：“如同當年麥哲倫的航海日志一樣，博客將工作、生活和學習融為一體，將日常的思想精華及時記錄和發布，萃取并聯接全球最有價值、最相關、最有意思的信息與資源。”
曾預言京東將成悲劇
在文章中懟網絡平臺早就是方興東的一種習慣了。據中國經濟網報道，早在2015年，方興東就在《阿里巴巴正傳：我們與馬云的“一步之遙”》一書的序言中放話稱京東將成悲劇。
當時微信朋友圈中瘋傳著一篇馬云“炮轟”京東的一篇文章，文章中“馬云”稱“京東將來會成為悲劇，千萬不要去碰京東，別到時候自己死了賴上我們”。此文一石激起千層浪，逼得馬云不得不通過微博緊急澄清。隨后人們才發現這是方興東書里的話，但是是馬云在私人場合對方興東說的。
發現事態不對的方興東隨即連發4條朋友圈，對在書中狂懟劉強東一事道歉。方興東在朋友圈中稱“肇事者是我，罪過。”方興東表示，序言引述了與馬云聊天時候的一些精彩觀點，但網上將序言截出來傳播很要命，并懇請讀者讀完序言全文不要斷章取義，更不要想當然去進一步演繹。
從始至終力挺賈躍亭
自從樂視危機爆發之后，媒體對賈躍亭的態度產生了劇變，從一開始創新先鋒的吹捧變成了現在“下周回國”的調侃，但方興東對賈躍亭的力挺卻始終如一。
2016年10月，賈躍亭承認樂視出現資金問題的前一個月，方興東撰文《賈躍亭和樂視是如何挑戰我們的常識、想象力和可能性?》，雖然他在個人微信公眾號中表態稱“不負責任，不做答案，僅供啟發”，但其力挺樂視的態度可見一斑。
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