朝云出生于三國時期普通的民家,荊州襄陽人。父親皇甫疾,乃昔日劉表麾下的水師參軍,荊州投降后,被曹魏所征召,后慘死于赤壁,母親韓氏,則于關羽北伐時,死于逃難途中。朝云為把剩余不多的干糧留給一起逃難的姊弟,決心自我犧牲,趁夜偷偷離開他們,躲在荒野中,后來在饑寒交迫之中昏死,為路過的名將趙云救起。趙云將他帶至一收容戰火孤兒的組織,讓他有棲身之所。后來,朝云在一次支援糧秣運輸工作中,意外以劍氣救了誤入曹賊陷阱中的趙云及所屬部隊,此后,趙云便夜夜蒙面,把朝云帶至營后的山上,傳授槍戟武術。最終朝云在天干十杰選拔中獲得首位拿下“焉逢”稱號,成為蜀漢精英部隊“飛羽”的“羽之部”領導人。
飛羽成立后,朝云率羽之部隊員為大漢立下了汗馬功勞。在一次執行任務的時候,被銅雀尊者阻攔,從此飛羽的行動屢次被銅雀阻撓。有一次去巫山時,橫艾的姐姐巫山仙子告訴了朝云,他自己是軒轅劍轉世,并激發了他的潛能。之后諸葛亮進行第五次北伐(是他一生最后一次北伐),勞民傷財,飛羽領導人叫羽之部(當時飛之部已被銅雀尊者瓦解)去刺殺諸葛亮。
銅雀白衣尊者(朝云的弟弟徐暮云)因為誤殺了自己的父親(養父)徐庶,決定遵從他的遺愿,保護諸葛丞相。朝云等人兩次刺殺諸葛亮也沒成功,在第三次刺殺行動中,白衣尊者和皇甫朝云在白衣尊者用盤古斧劈開的空間裂痕中決斗。
觀星臺最后的決斗中,朝云殺死白衣尊者,兩人劍氣合一,化為一人,朝云的黑發變成白,才知道白衣尊者是自己的親弟弟暮云,懊悔不已。為了實現弟弟的心愿,朝云叫他的未婚妻耶亞希在夷洲等著他,只身前往山海界拯救天女。橫艾告訴朝云此行必有兇險,請姊姊巫山仙子卜了卦,交給了朝云一個錦囊,讓其在山海界將意識交給弟弟暮云控制。